对话分析
Python 未配置
SpaCellAgent
基于大语言模型的智能单细胞 / 空间转录组学分析助手。上传数据文件,用自然语言描述分析目标,Agent 自动规划并执行。
📌 对 PBMC 数据进行标准单细胞分析流程
🔬 使用 PAGA 进行轨迹推断分析
🗺️ Squidpy 空间转录组分析
🔴 Harmony 多批次效应校正
📄
暂无报告,请先完成一次分析任务
#任务描述语言步骤状态创建时间操作
加载中…
选择 LLM 后端
DeepSeek
高性价比,中文支持优秀
OpenAI GPT-4
通用能力强,代码生成优秀
自定义 API
接入任意兼容 OpenAI 格式的模型
🔑API 配置
在对应平台获取
🎛运行参数
代码执行失败时自动重试的最大次数
开启后,轨迹推断步骤成功时自动搜索 PubMed 文献,用 LLM 验证生物学合理性。
Python 工具
R 工具
SpaCellAgent
SpaCellAgent
基于大语言模型的多智能体自动化单细胞/空间转录组学分析框架
🏗架构组件
Planner
将用户任务分解为有序步骤
ToolSelector
从工具注册表选择最合适的生信工具
CodeProgrammer
调用 LLM 生成 Python/R 代码
Evaluator
评估代码执行结果,提供改进建议
ErrorPatternLibrary
内置常见错误模式库
🖥启动后端
运行以下命令启动 FastAPI 后端服务:
bash📋 复制
pip install fastapi uvicorn python-multipart
uvicorn api:app --host 0.0.0.0 --port 8000 --reload
API 端点:
POST/api/upload上传数据文件
POST/api/tasks创建分析任务
GET/api/tasks/{id}/eventsSSE 实时流
GET/api/tasks/{id}/report获取报告
GET/api/history历史记录
POST/api/config保存配置